Untersuchung viraler und immunologischer Mechanismen in der Pathogenese der Demenz durch de-novo-Sequenzierung und Proteomanalyse
- Demenz ist eine der größten medizinischen Herausforderungen unserer Zeit – eine schleichende, zerstörerische Krankheit, die Millionen von Menschen betrifft und für die es bis heute keine Heilung gibt. Trotz jahrzehntelanger Forschung bleiben viele der zugrunde liegenden Mechanismen ein Rätsel. Neueste Erkenntnisse deuten da-rauf hin, dass nicht nur neurodegenerative Prozesse wie Proteinaggregation und oxi-dative Schäden eine Rolle spielen, sondern möglicherweise auch geschlechtsspezi-fische Unterschiede und sogar virale Einflüsse. Doch wie lassen sich solche Faktoren zuverlässig nachweisen? Diese Arbeit bricht mit konventionellen Methoden und nutzt De-Novo-Sequenzierung, um das Proteom menschlicher Gehirngewebe mit mo-dernsten bioinformatischen Werkzeugen zu analysieren. Ziel ist es, zwei grundle-gende Fragen zu beantworten: (1) Kann das biologische Geschlecht allein anhand von Proteindaten bestimmt werden? (2) Ist es möglich, Viren in Proteindaten zu er-kennen? Um diesen Fragen nachzugehen, wurden die leistungsfähigen Sequenzie-rungs-Tools Casanovo, DeepNovo und Novor eingesetzt, die eine datenbankunab-hängige Peptididentifikation ermöglichen. Zehntausende Peptide wurden analysiert, gruppiert und auf Muster untersucht, die Rückschlüsse auf geschlechtsspezifische oder virale Signaturen erlauben. Die Ergebnisse zeigen, dass geschlechtsspezifische Proteine zwar nachweisbar sind, doch die inkonsistente Peptidvorhersage zwischen den verwendeten Tools die Zuverlässigkeit dieser Marker infrage stellt. Noch span-nender ist die Erkenntnis, dass bestimmte Peptide auf mögliche virale Präsenz in den Daten hindeuten – ein Aspekt, der bislang kaum Beachtung fand, aber die Frage auf-wirft, ob Viren eine unerkannte Rolle in der Entstehung oder Verstärkung neurodege-nerativer Prozesse spielen könnten. Diese Studie verdeutlicht das enorme Potenzial der Proteomik für die Demenzforschung. Durch die Kombination von De-Novo-Se-quenzierung und bioinformatischer Analyse eröffnen sich neue Wege zur Identifika-tion von bisher unentdeckten molekularen Mechanismen. Die Ergebnisse liefern nicht nur wertvolle Impulse für die Grundlagenforschung, sondern könnten langfristig auch neue Perspektiven für die Diagnostik und Therapie neurodegenerativer Erkrankungen schaffen. Demenz ist ein Rätsel – doch die Antworten könnten bereits in den Proteinen verbor-gen liegen. Jetzt ist es an der Wissenschaft, sie zu entschlüsseln.
| Author: | Tara Fereydooni-Lotfabadi |
|---|---|
| URN: | urn:nbn:de:hbz:1393-opus4-15850 |
| DOI: | https://doi.org/10.71764/opus-1585 |
| Referee: | Jens Allmer |
| Advisor: | Jens Allmer |
| Document Type: | Bachelor Thesis |
| Language: | German |
| Year of Completion: | 2025 |
| Date of final exam: | 2025/02/26 |
| Release Date: | 2025/07/21 |
| Page Number: | 72 |
| Institutes: | Fachbereich 4 - Institut Mess- und Senstortechnik |
| DDC class: | 500 Naturwissenschaften und Mathematik / 500 Naturwissenschaften |
| Licence (German): | No Creative Commons |



